More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0605 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  71.03 
 
 		 652 aa  909    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  71.19 
 
 		 650 aa  924    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  71.19 
 
 		 654 aa  944    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 647 aa  1292    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  58.87 
 
 		 886 aa  287  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  43.01 
 
 		 630 aa  276  7e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  32.11 
 
 		 551 aa  223  7e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  38.97 
 
 		 451 aa  223  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  33.96 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  35.22 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  36.32 
 
 		 443 aa  217  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  34.52 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  33.76 
 
 		 466 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  30.75 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  32.73 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  32.73 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  31.76 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  32.45 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  30.56 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  31.68 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  31.68 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.48 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  32.22 
 
 		 590 aa  180  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  33.5 
 
 		 551 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  36.32 
 
 		 649 aa  173  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  31.57 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  35 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  31.96 
 
 		 517 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  34.1 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  31.41 
 
 		 479 aa  170  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  34.06 
 
 		 531 aa  169  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.95 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  35.43 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  31.47 
 
 		 479 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  35.03 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  33.89 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  32.16 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.58 
 
 		 550 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.59 
 
 		 548 aa  165  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 		 485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  34.83 
 
 		 451 aa  164  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  33.68 
 
 		 470 aa  161  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  32.91 
 
 		 550 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.89 
 
 		 558 aa  161  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  30.87 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.13 
 
 		 558 aa  160  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  34.75 
 
 		 451 aa  160  9e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  32.6 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.49 
 
 		 554 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  30.85 
 
 		 548 aa  158  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  34.36 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  30.25 
 
 		 558 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  30.98 
 
 		 549 aa  154  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  33.06 
 
 		 559 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  32.12 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  31.91 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  33.33 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.54 
 
 		 548 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  32.1 
 
 		 546 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  29.04 
 
 		 564 aa  150  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  32.07 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  32.9 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  31.38 
 
 		 555 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  33.24 
 
 		 556 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  32.5 
 
 		 545 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  33.8 
 
 		 545 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  30.79 
 
 		 549 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  33.97 
 
 		 658 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  31.55 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  30.87 
 
 		 542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.79 
 
 		 548 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  32.28 
 
 		 550 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.21 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  30.13 
 
 		 951 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  28.01 
 
 		 796 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  26.46 
 
 		 866 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  28.28 
 
 		 489 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  28.32 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  28.28 
 
 		 489 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 698 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.27 
 
 		 998 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  26.55 
 
 		 773 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 		 706 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 967 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  25.82 
 
 		 809 aa  104  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  25.82 
 
 		 809 aa  104  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  24.86 
 
 		 838 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  25.06 
 
 		 778 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>