More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0601 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1780  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 1053 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0700208  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1197  isoleucyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 991 aa  1105    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000165985  hitchhiker  0.0000378196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0677  isoleucyl-tRNA synthetase  78.71 
 
 		 977 aa  1629    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 1066 aa  671    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00020204  hitchhiker  0.0000151931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1993  isoleucyl-tRNA synthetase  78.88 
 
 		 980 aa  1616    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 975 aa  672    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0929  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 1049 aa  669    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0130  isoleucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 1062 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.15677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1650  isoleucyl-tRNA synthetase  78.67 
 
 		 977 aa  1630    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 1024 aa  635    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0601  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 977 aa  1984    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 1058 aa  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0185  isoleucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 1058 aa  629  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.232804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 1068 aa  632  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0403  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 1059 aa  616  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.171836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 1039 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0945  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 1040 aa  598  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0606  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 1062 aa  598  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.63379  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 1039 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 1046 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0152  isoleucyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 1060 aa  595  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0198182 
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 1014 aa  589  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 1066 aa  591  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2269  isoleucyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 1076 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.585384  normal  0.126832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 1033 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 1033 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 1014 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 1033 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000414459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 1033 aa  582  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 1033 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 1061 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 1014 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 1033 aa  581  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 1033 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 1033 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 1033 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 1033 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0104  isoleucyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 1034 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 1077 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 1066 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0784  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 1033 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 1037 aa  558  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0719  isoleucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 1034 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.280166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1199  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 1034 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.847726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0887  isoleucyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 1050 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1825  isoleucyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 1068 aa  547  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 1060 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 1073 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0089  isoleucyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 1068 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 1091 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 1049 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1055  isoleucyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 1089 aa  541  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0633304  normal  0.357924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 1066 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 1083 aa  537  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 1069 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 1049 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 1081 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 1065 aa  533  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 1069 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 1080 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 1089 aa  532  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 1079 aa  532  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 1080 aa  529  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000389774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 1085 aa  525  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 1054 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 1086 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 1059 aa  522  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1744  isoleucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 1070 aa  522  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 1100 aa  519  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 1093 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 1051 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 1084 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 1048 aa  512  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 1042 aa  507  9.999999999999999e-143  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 1075 aa  509  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 1031 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 1091 aa  496  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 1110 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 1036 aa  489  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 1037 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 1091 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 1108 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0688  isoleucyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 1048 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.973348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0044  isoleucyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 1148 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3644  isoleucyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 1042 aa  459  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 1134 aa  459  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11569  isoleucyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 1041 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 1056 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 1129 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 1137 aa  450  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3866  isoleucyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 1059 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.265551  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 1133 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 1082 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 908 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  31.89 
 
 		 1135 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 927 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 919 aa  446  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4664  isoleucyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 1143 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0311577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2769  isoleucyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 1082 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>