14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0546 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  62.15 
 
 		 217 aa  292  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  64.19 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  64.2 
 
 		 178 aa  248  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0576  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.38 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.252977  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.32 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  24.71 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  26.04 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0985  CRISPR-associated protein Cas4  29.31 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0923748  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.04 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  26.09 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.95 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.28 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>