More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0545 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  73.92 
 
 
549 aa  830    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0545  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1202    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  58.26 
 
 
643 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  56.64 
 
 
639 aa  552  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  47.36 
 
 
617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  37.66 
 
 
654 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.33 
 
 
713 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  35.63 
 
 
659 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  35.63 
 
 
661 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  32.08 
 
 
730 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  34.16 
 
 
718 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  32.42 
 
 
752 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  33.94 
 
 
732 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.4 
 
 
679 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.86 
 
 
737 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  32 
 
 
727 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35 
 
 
658 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.52 
 
 
658 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.57 
 
 
664 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.36 
 
 
656 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.12 
 
 
656 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.57 
 
 
664 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  36.7 
 
 
683 aa  256  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  33.4 
 
 
683 aa  256  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  33.4 
 
 
716 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  36.45 
 
 
655 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.48 
 
 
694 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.39 
 
 
655 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.32 
 
 
717 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.25 
 
 
686 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.65 
 
 
663 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.85 
 
 
663 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.93 
 
 
699 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.97 
 
 
698 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  35.82 
 
 
661 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  34.99 
 
 
716 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  35.13 
 
 
661 aa  249  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  31.16 
 
 
678 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  34.68 
 
 
699 aa  248  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.35 
 
 
699 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  32.44 
 
 
762 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  36.34 
 
 
652 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  32.89 
 
 
1033 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  34.16 
 
 
703 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  34.16 
 
 
703 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.49 
 
 
694 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.48 
 
 
712 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.58 
 
 
774 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.42 
 
 
989 aa  243  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.2 
 
 
722 aa  243  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 
658 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  34.16 
 
 
703 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
703 aa  242  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
703 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
703 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
703 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  33.71 
 
 
703 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
703 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  33.94 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  34.03 
 
 
727 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.39 
 
 
762 aa  241  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  33.08 
 
 
671 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  32.65 
 
 
661 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  33.17 
 
 
678 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  29.11 
 
 
615 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  31.52 
 
 
1388 aa  237  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.27 
 
 
722 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.03 
 
 
703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.27 
 
 
714 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  33.25 
 
 
663 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  31.93 
 
 
711 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.53 
 
 
748 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.06 
 
 
683 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.17 
 
 
676 aa  234  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.71 
 
 
711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.71 
 
 
711 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.89 
 
 
723 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.35 
 
 
737 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  31.96 
 
 
661 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.18 
 
 
629 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  33.42 
 
 
386 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  30.18 
 
 
1027 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.56 
 
 
662 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.82 
 
 
662 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.07 
 
 
743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  38.07 
 
 
739 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  29.77 
 
 
882 aa  226  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.66 
 
 
721 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.41 
 
 
1215 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  33.85 
 
 
662 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.28 
 
 
383 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.34 
 
 
1046 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  32.02 
 
 
1042 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.53 
 
 
758 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  34.62 
 
 
653 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  32.34 
 
 
1046 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  33.72 
 
 
650 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  33.57 
 
 
654 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  33.72 
 
 
650 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  29.81 
 
 
650 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>