34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0460 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  43.19 
 
 
206 aa  158  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0222  hypothetical protein  43.21 
 
 
327 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  38.42 
 
 
353 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0093  hypothetical protein  45.9 
 
 
311 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000428603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  28.23 
 
 
305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0038  hypothetical protein  42.54 
 
 
269 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  47.87 
 
 
219 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0952  hypothetical protein  26.45 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0012758  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  47.83 
 
 
386 aa  61.6  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  41.82 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  43.53 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  45.05 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  35.71 
 
 
317 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  35.4 
 
 
284 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  65 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0067  hypothetical protein  37.35 
 
 
91 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125226  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  34.57 
 
 
336 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  35.45 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  31.46 
 
 
321 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  34.04 
 
 
270 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  45.71 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  43.42 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  33.63 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  31.18 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  35.2 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1907  paREP7  36.46 
 
 
303 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000000796589  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3103  hypothetical protein  26.28 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0219487  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  26.91 
 
 
253 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1766  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1375  hypothetical protein  25.79 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  32.17 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  28.7 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>