51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0419 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0419  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  71.53 
 
 
297 aa  362  3e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1548  hypothetical protein  56.72 
 
 
219 aa  267  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  44.24 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0989  hypothetical protein  34.36 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.132758  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  32.25 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1920  hypothetical protein  39.25 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1170  hypothetical protein  38.55 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0259926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  33.6 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0437  hypothetical protein  45.64 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1627  hypothetical protein  37.61 
 
 
294 aa  125  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00194583  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2328  hypothetical protein  31.22 
 
 
256 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.698031  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4234  Protein of unknown function DUF1626  26.69 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1976  hypothetical protein  38.69 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000586901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4195  Protein of unknown function DUF1626  26.69 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1072  hypothetical protein  47.57 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.304238  normal  0.0380408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2960  Protein of unknown function DUF1626  33.33 
 
 
233 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635149 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1977  hypothetical protein  43.85 
 
 
368 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.529646  hitchhiker  0.0000143313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1071  hypothetical protein  43.08 
 
 
317 aa  106  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0452  hypothetical protein  39.74 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0534  hypothetical protein  39.5 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1477  hypothetical protein  38.81 
 
 
224 aa  89  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.206877  normal  0.225419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0737  Protein of unknown function DUF1626  38.21 
 
 
252 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000438836  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0991  hypothetical protein  29.27 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.95618  normal  0.04449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1705  hypothetical protein  25.1 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.594083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1429  hypothetical protein  42.11 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.220825  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  35.05 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1685  hypothetical protein  35.06 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000183285  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  27.73 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1757  hypothetical protein  28.82 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0185  paREP7  38.76 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  0.966821 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1148  hypothetical protein  31.74 
 
 
220 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0283624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  28.85 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0327  paREP7  35.66 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1695  paREP7  32.52 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1408  paREP7  35.65 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165903  normal  0.389588 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1150  hypothetical protein  32 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  0.0462883 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0460  hypothetical protein  40.45 
 
 
212 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1156  hypothetical protein  39.24 
 
 
149 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00874772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2036  hypothetical protein  31.06 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  29.08 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1276  hypothetical protein  31.51 
 
 
244 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.160585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  30.61 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  42.65 
 
 
148 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  42.65 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1542  paREP7  30.08 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.380993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1516  hypothetical protein  31.01 
 
 
195 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000303236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0971  hypothetical protein  34.83 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.801412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0492  hypothetical protein  32.73 
 
 
229 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  32.91 
 
 
212 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>