175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0360 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  84.78 
 
 
368 aa  664    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  100 
 
 
368 aa  740    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  82.88 
 
 
368 aa  649    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  82.88 
 
 
368 aa  634    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  52.62 
 
 
379 aa  402  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  45.24 
 
 
382 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.58 
 
 
389 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.2 
 
 
407 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.15 
 
 
382 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.86 
 
 
375 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  43.63 
 
 
390 aa  149  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  44.2 
 
 
506 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  46.63 
 
 
498 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.8 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  39.31 
 
 
489 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  31.79 
 
 
376 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  39.11 
 
 
509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.29 
 
 
387 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  41.21 
 
 
509 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  46.27 
 
 
466 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.48 
 
 
547 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  44.68 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  35.2 
 
 
546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.28 
 
 
477 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.16 
 
 
526 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.28 
 
 
436 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.79 
 
 
528 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  35.14 
 
 
553 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  35.75 
 
 
498 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  33.03 
 
 
498 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  34.97 
 
 
523 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  34.59 
 
 
553 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  33.51 
 
 
552 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  34.86 
 
 
499 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  34.78 
 
 
512 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  35.2 
 
 
506 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  34.78 
 
 
512 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  34.78 
 
 
512 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  35.2 
 
 
498 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  36.22 
 
 
499 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  36.22 
 
 
499 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  35.71 
 
 
560 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  37.04 
 
 
543 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  36.88 
 
 
530 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  35.91 
 
 
498 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  34.46 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  34.46 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  34.46 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  34.46 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  34.46 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  37.01 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.72 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.36 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  29.94 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.09 
 
 
315 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  26.39 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  27.88 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.8 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  27.88 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  27.88 
 
 
320 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  27.6 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  28.74 
 
 
385 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  26.7 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  27.67 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.45 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.81 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.65 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  27.4 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  27.4 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  26.58 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  25.12 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  29.34 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  29.34 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  29.34 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  27.27 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  26.14 
 
 
323 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  27.4 
 
 
320 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.34 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  24.51 
 
 
363 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.14 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  24 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.9 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  26.92 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.93 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0388  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.54 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.004479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  24.38 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  22.35 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0714  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  27.81 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.669809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  28 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  21.83 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  27.27 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  24.23 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  22.35 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.78 
 
 
310 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>