More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0161 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  77.24 
 
 		 278 aa  424  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  71.05 
 
 		 266 aa  388  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0841  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0550321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  30.04 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.7 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.91 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.98 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.84 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.89 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  26.5 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.32 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.32 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.36 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  26.51 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.51 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  26.51 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  33.71 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.44 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.44 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.81 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.55 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  25.52 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.04 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  34.48 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  27.39 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  26.84 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.35 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.08 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.4 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.13 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  29.7 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.52 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.42 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.58 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  34.65 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.32 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.65 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.32 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  27.22 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.85 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  32.11 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.12 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  31.63 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.23 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  31.48 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 		 566 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.35 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  26.49 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.13 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.86 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  28.02 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  27.57 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.8 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  32.77 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.29 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.9 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>