12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0090 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1156  hypothetical protein  57.77 
 
 		 846 aa  899    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1690    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0119  hypothetical protein  48.57 
 
 		 901 aa  751    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0112  hypothetical protein  57.77 
 
 		 846 aa  879    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0116921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1462  hypothetical protein  28.54 
 
 		 689 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.947543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1873  hypothetical protein  31.93 
 
 		 603 aa  56.6  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  28.48 
 
 		 510 aa  55.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  28.05 
 
 		 509 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  26.22 
 
 		 509 aa  47  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  26.67 
 
 		 944 aa  47  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  24.26 
 
 		 487 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  37.36 
 
 		 400 aa  45.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>