147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0084 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  92.46 
 
 
682 aa  1246    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  52.55 
 
 
693 aa  674    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  92.32 
 
 
680 aa  1248    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  100 
 
 
679 aa  1352    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  92.48 
 
 
680 aa  1233    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  59.82 
 
 
688 aa  826    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  49.12 
 
 
686 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  48.25 
 
 
686 aa  593  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  41.97 
 
 
689 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  41.37 
 
 
700 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  37.76 
 
 
700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  40.12 
 
 
695 aa  450  1e-125  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  38.16 
 
 
696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  38.59 
 
 
694 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  36.98 
 
 
700 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  38 
 
 
706 aa  429  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  38.71 
 
 
703 aa  429  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  38.75 
 
 
717 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  36.96 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  39.7 
 
 
890 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  37.81 
 
 
882 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  38.15 
 
 
791 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  38.16 
 
 
729 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  38.21 
 
 
667 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  38.47 
 
 
796 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  38.65 
 
 
724 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  38.14 
 
 
808 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  37.46 
 
 
841 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  37.06 
 
 
989 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  42.05 
 
 
788 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  38.5 
 
 
709 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  41.59 
 
 
795 aa  364  3e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  39.29 
 
 
717 aa  364  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  38.62 
 
 
932 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  40.7 
 
 
811 aa  361  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  36.39 
 
 
739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  39.11 
 
 
949 aa  357  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  41.73 
 
 
618 aa  347  6e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  36.53 
 
 
859 aa  345  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  41.3 
 
 
551 aa  344  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  35.67 
 
 
848 aa  343  5.999999999999999e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.15 
 
 
963 aa  342  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  38.67 
 
 
707 aa  342  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.6 
 
 
876 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  37.15 
 
 
847 aa  320  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  36.73 
 
 
556 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  34.94 
 
 
915 aa  300  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  34.91 
 
 
672 aa  296  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.79 
 
 
672 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  34.16 
 
 
676 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  31.89 
 
 
676 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  35.34 
 
 
674 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  35.26 
 
 
674 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  35.99 
 
 
674 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  40.76 
 
 
873 aa  281  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  45.79 
 
 
660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  35.18 
 
 
761 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  32.83 
 
 
676 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  32.38 
 
 
674 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  41.19 
 
 
1064 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  32.32 
 
 
675 aa  270  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  33.91 
 
 
670 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  33.22 
 
 
676 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  32.83 
 
 
668 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  28.67 
 
 
710 aa  259  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  38.48 
 
 
1342 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  28.89 
 
 
717 aa  257  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  38.44 
 
 
1059 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  28.61 
 
 
710 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  28.34 
 
 
710 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  28.29 
 
 
710 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  29.14 
 
 
717 aa  249  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  40.3 
 
 
458 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  35.57 
 
 
487 aa  242  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  29.58 
 
 
710 aa  234  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  33.53 
 
 
467 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  30.29 
 
 
724 aa  213  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  37.67 
 
 
1412 aa  207  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  28.25 
 
 
626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  27.59 
 
 
677 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  27.59 
 
 
677 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  29.3 
 
 
607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  27.18 
 
 
314 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  28.46 
 
 
513 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.81 
 
 
342 aa  51.2  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  32.4 
 
 
507 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  28.37 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  28.37 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  27.27 
 
 
506 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  31.03 
 
 
748 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  26.8 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.49 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  24.22 
 
 
507 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  26.29 
 
 
514 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  24.13 
 
 
507 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  29.07 
 
 
507 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.08 
 
 
331 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  26.98 
 
 
506 aa  48.5  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.27 
 
 
337 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  23 
 
 
504 aa  47.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>