More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0075 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0075  prephenate dehydratase  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0102  prephenate dehydratase  80 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00124161 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0111  prephenate dehydratase  75.29 
 
 		 279 aa  387  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1150  prephenate dehydratase  73.26 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  5.713990000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1344  prephenate dehydratase  39.85 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00546252  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1223  Prephenate dehydratase  38.31 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.95 
 
 		 358 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.55 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  36.74 
 
 		 361 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.21 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.46 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.46 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.07 
 
 		 355 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.58 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  35.19 
 
 		 360 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.4 
 
 		 371 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.85 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  33.21 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  34.09 
 
 		 365 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  32.95 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  34.6 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  33.33 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  33.33 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  33.08 
 
 		 366 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  33.71 
 
 		 364 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  31.95 
 
 		 402 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  33.33 
 
 		 364 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  34.98 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  33.33 
 
 		 364 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.09 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  32.46 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  32.58 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  35.25 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  34.72 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  34.72 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.46 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.21 
 
 		 364 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.96 
 
 		 368 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.95 
 
 		 373 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.22 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  33.21 
 
 		 364 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  34.89 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  32.58 
 
 		 365 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  34.77 
 
 		 377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  34.21 
 
 		 355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.47 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.08 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  32.2 
 
 		 365 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 355 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  34.83 
 
 		 373 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.71 
 
 		 382 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  34.77 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  32.71 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  30.94 
 
 		 379 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  35.85 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.33 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  33.94 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  32.59 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  31.14 
 
 		 413 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0771  prephenate dehydratase  31.68 
 
 		 552 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  35.23 
 
 		 362 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  32.46 
 
 		 399 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  35.32 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  29.06 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0794  prephenate dehydratase  31.3 
 
 		 552 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  33.33 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  31.34 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  30.6 
 
 		 381 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.94 
 
 		 368 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  32.71 
 
 		 391 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 360 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 372 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  35.16 
 
 		 386 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  29.96 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  31.7 
 
 		 359 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  29.96 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.96 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  32.09 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.93 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.93 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  31.07 
 
 		 293 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  31.32 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  32.95 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0012  prephenate dehydratase  36.65 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000330103  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  31.32 
 
 		 392 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  33.08 
 
 		 365 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  30.88 
 
 		 657 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>