33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0065 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0100  hypothetical protein  72.09 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0092  hypothetical protein  76.74 
 
 		 129 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.741351  normal  0.223758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1331  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 		 133 aa  89.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.238415  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1605  peroxiredoxins-like protein  35.61 
 
 		 133 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.438042  normal  0.500457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  32.58 
 
 		 130 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.56 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  29.32 
 
 		 131 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  30 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  24.69 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  24.07 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  24.07 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  27.21 
 
 		 139 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 		 864 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  23.46 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  22.84 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  22.84 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  23.46 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  23.18 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.22 
 
 		 817 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  23.31 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  22 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  22 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  27.45 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  26.97 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  26.12 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  26.8 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  24.4 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24 
 
 		 817 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>