More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0043 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  69.91 
 
 		 225 aa  305  3e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  68.14 
 
 		 225 aa  305  3e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  63.72 
 
 		 225 aa  287  8e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1341  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000168829  normal  0.809045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 776 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  27.4 
 
 		 341 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  29.6 
 
 		 476 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  26.94 
 
 		 341 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 		 367 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 351 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  26.48 
 
 		 345 aa  99.8  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 350 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 350 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  26.2 
 
 		 352 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 357 aa  96.3  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 329 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  27.73 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.19 
 
 		 356 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  26.94 
 
 		 348 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.68 
 
 		 820 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.64 
 
 		 353 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  32.39 
 
 		 833 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 		 351 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.91 
 
 		 352 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 		 349 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  30 
 
 		 352 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  29.33 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  32.39 
 
 		 712 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.29 
 
 		 320 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 348 aa  88.6  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.02 
 
 		 843 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  27.27 
 
 		 784 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 835 aa  88.2  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  27.27 
 
 		 784 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.07 
 
 		 820 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  33.7 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 		 346 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 		 370 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 		 370 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.25 
 
 		 364 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  31.68 
 
 		 319 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.68 
 
 		 832 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  26.87 
 
 		 784 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  25.23 
 
 		 352 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  26.87 
 
 		 784 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  27.31 
 
 		 785 aa  85.1  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.32 
 
 		 784 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  29.44 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.28 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 841 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  29.79 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  29.15 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 818 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  29.94 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.83 
 
 		 837 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  30.46 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  32.29 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.46 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  27.68 
 
 		 827 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.23 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  31.49 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  26.46 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 842 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.68 
 
 		 352 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 842 aa  81.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 361 aa  81.6  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0210  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.2 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 353 aa  81.6  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.97 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1479  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.99 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  26.87 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  26.87 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  27.73 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  26.79 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  31.58 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  32.89 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  27.73 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 828 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  27.73 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  31 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 840 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  28.05 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>