More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0022 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0022  enolase  100 
 
 		 411 aa  813    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0053  phosphopyruvate hydratase  82.49 
 
 		 417 aa  689    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0387594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0056  phosphopyruvate hydratase  81.29 
 
 		 419 aa  668    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1098  phosphopyruvate hydratase  81.53 
 
 		 417 aa  663    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0197  phosphopyruvate hydratase  58.92 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000900243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1238  phosphopyruvate hydratase  45.57 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0269963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0429  enolase  46.93 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2216  phosphopyruvate hydratase  45.5 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2379  phosphopyruvate hydratase  42.5 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00363465  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1809  phosphopyruvate hydratase  45.39 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2893  phosphopyruvate hydratase  45.61 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00235502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2545  enolase  46.17 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2598  phosphopyruvate hydratase  44.14 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1303  Phosphopyruvate hydratase  42.89 
 
 		 401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.50903  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2515  phosphopyruvate hydratase  43.28 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0317  phosphopyruvate hydratase  36.45 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1825  phosphopyruvate hydratase  41.79 
 
 		 400 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0112  phosphopyruvate hydratase  39.66 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  37.11 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  37.86 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  37.86 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  37.86 
 
 		 429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  37.83 
 
 		 429 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  36.41 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  39.52 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  37.23 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  37.59 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1668  phosphopyruvate hydratase  37.23 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0010021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  37.68 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  38.11 
 
 		 426 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  36.34 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  37.62 
 
 		 426 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  38.24 
 
 		 425 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  39.32 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  37.5 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  36.23 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  39.56 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  37.2 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  37.2 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  35.04 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  38.54 
 
 		 429 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  37.47 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  36.17 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  38.83 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  37.47 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  39.27 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2850  phosphopyruvate hydratase  36.74 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.647479  hitchhiker  0.00365669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  37.2 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  36.17 
 
 		 430 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  36.06 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  38.83 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  36.1 
 
 		 427 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  37.92 
 
 		 430 aa  239  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  37.05 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  37.05 
 
 		 425 aa  239  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  37.14 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  36.71 
 
 		 430 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  36.89 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  34.94 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  36.56 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  36.56 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  38.29 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  37.62 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  36.98 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1687  phosphopyruvate hydratase  37.38 
 
 		 425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 		 425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  35.68 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  38.83 
 
 		 426 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  35.9 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  36.74 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  35.11 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  37.2 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  36.28 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  37.05 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  35.11 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  35.92 
 
 		 427 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  37.71 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  38.44 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  38.13 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  37.77 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  36.74 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  36.8 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  36.23 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  35.92 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  35.92 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  35.92 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0489  phosphopyruvate hydratase  34.38 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  35.59 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  35.35 
 
 		 429 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  36.89 
 
 		 427 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1253  Phosphopyruvate hydratase  36.56 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  35.68 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  37.62 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>