172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0021 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  83.08 
 
 		 202 aa  357  6e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  84.58 
 
 		 201 aa  356  9.999999999999999e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  86.07 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  62.64 
 
 		 206 aa  247  8e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  54.55 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  49.49 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  49.73 
 
 		 211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  44.21 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  44.21 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  46.45 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  41.67 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  43.33 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  42.93 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  41.76 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  41.79 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  39.59 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  42.08 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  42.08 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  41.49 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.7 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  38.25 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  40.22 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  43.72 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.56 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  41.53 
 
 		 212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  35.23 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.78 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  39.23 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.86 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  34.62 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  35.45 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.64 
 
 		 243 aa  104  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  32 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.71 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  37.08 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  33.33 
 
 		 297 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.6 
 
 		 282 aa  98.2  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.1 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36 
 
 		 237 aa  95.5  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.32 
 
 		 301 aa  94.7  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.65 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  36.61 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  32.56 
 
 		 303 aa  92.8  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  35.33 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  31.66 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  36.53 
 
 		 259 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.66 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.94 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  26.79 
 
 		 232 aa  85.5  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  35.93 
 
 		 259 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  38.73 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  30.15 
 
 		 270 aa  85.1  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  28.14 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  34.07 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  35.33 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.64 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  34.73 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.22 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  28.89 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.05 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  34.13 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  34.2 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  29.38 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  26.8 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  26.53 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.95 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  31.98 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  31.05 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  31.66 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  29.35 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.35 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  32.16 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  28.24 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.13 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  26.13 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.94 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.93 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  27.13 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  26.15 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  36.13 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.36 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  31.55 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  30.37 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  28.72 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  27 
 
 		 304 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  26.34 
 
 		 290 aa  68.2  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  27.88 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  31.52 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.24 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.77 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  31.66 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  25.53 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  30.35 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  31.76 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>