281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0010 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  95.7 
 
 		 258 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  93.75 
 
 		 258 aa  482  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  92.19 
 
 		 258 aa  474  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  65.85 
 
 		 287 aa  328  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0456  putative circadian clock protein, KaiC  48.74 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  43.98 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  42.39 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  41.46 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  41.06 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  39.84 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  37.55 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  34.87 
 
 		 514 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  32.62 
 
 		 510 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 498 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  34.85 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  34.02 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  34.02 
 
 		 509 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  34.89 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  32.99 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  33.51 
 
 		 509 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  32.19 
 
 		 510 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  31.98 
 
 		 500 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  34 
 
 		 512 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 519 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  31.47 
 
 		 500 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  31.13 
 
 		 575 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  34.02 
 
 		 528 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  34.72 
 
 		 519 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 		 488 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  34.54 
 
 		 514 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  35.94 
 
 		 575 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  35.94 
 
 		 575 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  28.33 
 
 		 509 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  30.57 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  32.35 
 
 		 506 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  32.47 
 
 		 519 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  33.68 
 
 		 520 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  33.85 
 
 		 521 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  33.85 
 
 		 521 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  31.75 
 
 		 573 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  34.9 
 
 		 567 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  34.39 
 
 		 584 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 		 507 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  32.49 
 
 		 507 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  31.22 
 
 		 569 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  32.28 
 
 		 574 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  32.64 
 
 		 565 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  33.85 
 
 		 562 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  32.23 
 
 		 570 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  33.33 
 
 		 570 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  29.38 
 
 		 574 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  34.11 
 
 		 562 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  34.36 
 
 		 563 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  32.02 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  28.79 
 
 		 559 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  31.45 
 
 		 467 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  29.38 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  28.81 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  31 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  35.18 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.92 
 
 		 504 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  28.63 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  29.51 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1808  circadian clock protein KaiC  27.47 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  25.7 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  31.42 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  26.32 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  29.2 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  28 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0226  putative circadian clock protein, KaiC  24.72 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.728159  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  26.9 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  28.5 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  28.38 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  42.39 
 
 		 505 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  28.32 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 		 489 aa  72  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  27.49 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0781  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit C-like protein  29.84 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207407  unclonable  0.000000000000156433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  26.2 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  29.61 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  27.56 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  28.21 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  30.37 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  27.9 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  29.75 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  29.54 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  29.39 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  28.69 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  26.07 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  26.07 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  47.3 
 
 		 494 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 494 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  36.04 
 
 		 502 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  28.32 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  27.11 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  28.12 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>