More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4268 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 416 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.52 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.99 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.18 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.93 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.3 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.04 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.28 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.77 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.75 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.26 
 
 		 423 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.76 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.5 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.75 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.75 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.39 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.8 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.8 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.04 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.48 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.72 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.97 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.47 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.37 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.73 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.52 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.33 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 		 421 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.73 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.73 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.11 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 423 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.79 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.21 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.51 
 
 		 421 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.16 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.55 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.84 
 
 		 422 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.12 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.78 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.94 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.36 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.98 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>