More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4211 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  62.62 
 
 
546 aa  658  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  70.21 
 
 
529 aa  771  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  61.01 
 
 
543 aa  660  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  654  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.07 
 
 
544 aa  639  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  62.62 
 
 
546 aa  658  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  58.55 
 
 
544 aa  636  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  61.38 
 
 
543 aa  654  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  61.27 
 
 
546 aa  673  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.29 
 
 
544 aa  638  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  62.62 
 
 
546 aa  658  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  62.62 
 
 
546 aa  658  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.85 
 
 
546 aa  667  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.37 
 
 
545 aa  653  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  61.38 
 
 
543 aa  654  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
546 aa  665  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  61.38 
 
 
543 aa  654  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  66.94 
 
 
522 aa  673  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  62.62 
 
 
546 aa  658  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.67 
 
 
545 aa  664  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  60.71 
 
 
546 aa  671  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
544 aa  1122  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.47 
 
 
549 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.68 
 
 
549 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.4 
 
 
543 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  54.92 
 
 
549 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  54.73 
 
 
549 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  54.92 
 
 
549 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.73 
 
 
549 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.8 
 
 
549 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.8 
 
 
549 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.99 
 
 
549 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  6.73337e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.55 
 
 
549 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.99 
 
 
549 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  54.36 
 
 
549 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.55 
 
 
549 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.91 
 
 
546 aa  615  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  53.63 
 
 
549 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.8 
 
 
549 aa  613  1e-174  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54 
 
 
549 aa  602  1e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.8 
 
 
544 aa  602  1e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.73 
 
 
558 aa  563  1e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  54.41 
 
 
553 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.76 
 
 
547 aa  540  1e-152  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.84 
 
 
540 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.51 
 
 
533 aa  540  1e-152  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.51 
 
 
533 aa  540  1e-152  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  55.35 
 
 
549 aa  541  1e-152  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.05 
 
 
540 aa  541  1e-152  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.04 
 
 
547 aa  540  1e-152  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.5 
 
 
539 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  54.93 
 
 
549 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.11 
 
 
539 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  55.74 
 
 
537 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.76 
 
 
557 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.94 
 
 
553 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  57.56 
 
 
534 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.05 
 
 
539 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  58.35 
 
 
527 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.94 
 
 
509 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  57.85 
 
 
561 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  51.36 
 
 
542 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.75 
 
 
556 aa  516  1e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.28 
 
 
534 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.68 
 
 
506 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.05 
 
 
540 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.7 
 
 
546 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.63 
 
 
525 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.25 
 
 
527 aa  508  1e-142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  52.02 
 
 
541 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.1 
 
 
525 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.31 
 
 
525 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.82 
 
 
541 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.1 
 
 
525 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.1 
 
 
525 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.3 
 
 
525 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.78 
 
 
525 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.1 
 
 
525 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.05 
 
 
522 aa  494  1e-138  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33652e-06 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.19 
 
 
514 aa  493  1e-138  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.89 
 
 
525 aa  493  1e-138  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.1 
 
 
525 aa  492  1e-138  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51 
 
 
504 aa  491  1e-138  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.43 
 
 
525 aa  494  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.61 
 
 
525 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.4 
 
 
525 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.71 
 
 
522 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.4 
 
 
525 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.4 
 
 
525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.4 
 
 
525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.32 
 
 
521 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  52.4 
 
 
525 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.83 
 
 
521 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>