103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4210 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  40.29 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  41.18 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  40.3 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  37.62 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  34.93 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  36.23 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  31.4 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  31.66 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  28.02 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  30.05 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  32.55 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  26.96 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  27 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  27.18 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  33.49 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  29.25 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  27.5 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  27.32 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  31.9 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  28.8 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  30.69 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  26.5 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  26.5 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  29.67 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  26.5 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  31.07 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  29.35 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.26 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  26.47 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  30.61 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  30.2 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  29.68 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  29.86 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.7 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  28.5 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.96 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  24.51 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  23.41 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  22.93 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  23.56 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  24.15 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  23.04 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  25.96 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  25.39 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  27.52 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.21 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  27.55 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  25 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  22.66 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  25 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  25.51 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  24.87 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  24.76 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  23.72 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  23.76 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  24 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  26.89 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  23.5 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  24 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  21.94 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  23.04 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  21.47 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  23.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  22.84 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  22.92 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  21.03 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>