More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4153 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  100 
 
 
152 aa  309  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  73.83 
 
 
150 aa  229  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  74.83 
 
 
152 aa  216  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  56.46 
 
 
151 aa  177  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  53.74 
 
 
151 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  51.05 
 
 
160 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  56.64 
 
 
173 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  48.57 
 
 
145 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  48.61 
 
 
146 aa  146  1e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  46.53 
 
 
143 aa  145  2e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  48.65 
 
 
150 aa  145  2e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  49.29 
 
 
165 aa  145  2e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  48.59 
 
 
145 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  46.48 
 
 
148 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  47.55 
 
 
149 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  45.45 
 
 
148 aa  140  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  46.21 
 
 
148 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  51.8 
 
 
153 aa  139  1e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  47.18 
 
 
150 aa  139  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  47.83 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
149 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  45.83 
 
 
148 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  49.31 
 
 
151 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
145 aa  134  3e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  42.66 
 
 
146 aa  134  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  45.14 
 
 
154 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  44.76 
 
 
144 aa  134  6e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  44.93 
 
 
139 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  48.89 
 
 
146 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  44.14 
 
 
146 aa  132  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.39 
 
 
146 aa  132  1e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
154 aa  133  1e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  43.45 
 
 
153 aa  132  2e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  43.48 
 
 
139 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  42.25 
 
 
146 aa  130  8e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  43.57 
 
 
147 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  43.57 
 
 
147 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
147 aa  129  1e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
147 aa  129  1e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
147 aa  129  1e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  42.66 
 
 
146 aa  129  2e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
147 aa  127  7e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  43.45 
 
 
148 aa  126  9e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
148 aa  126  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  42.25 
 
 
146 aa  125  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  50 
 
 
131 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  43.26 
 
 
145 aa  124  4e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.21 
 
 
149 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
144 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  41.1 
 
 
148 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.96 
 
 
149 aa  121  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
148 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  45.11 
 
 
181 aa  119  2e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
148 aa  118  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  40 
 
 
153 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 
143 aa  117  4e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
144 aa  117  8e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
144 aa  116  8e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  40.28 
 
 
146 aa  116  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
152 aa  115  2e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  42.03 
 
 
147 aa  115  2e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
162 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  40.28 
 
 
146 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  38.62 
 
 
148 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 
153 aa  114  4e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
149 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
148 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
162 aa  113  9e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  39.46 
 
 
150 aa  113  1e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  33.1 
 
 
154 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  42.25 
 
 
145 aa  112  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  42.07 
 
 
143 aa  112  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  38.41 
 
 
146 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 
148 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  39.31 
 
 
150 aa  111  4e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  38.41 
 
 
146 aa  110  7e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 
154 aa  110  8e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  38.3 
 
 
167 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  40.97 
 
 
160 aa  109  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  40.6 
 
 
148 aa  109  1e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  39.13 
 
 
149 aa  109  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  37.59 
 
 
150 aa  108  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40.69 
 
 
151 aa  108  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6493e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
153 aa  108  2e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 
144 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
141 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  40.15 
 
 
147 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  32.62 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.62 
 
 
150 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.02211e-09  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  40.58 
 
 
153 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
145 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>