52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4113 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  66.91 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  61.03 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  58.91 
 
 		 139 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  33.64 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  32.11 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  32.71 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  30.58 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  30.51 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  29.58 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.81 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  26.83 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  31.86 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  32.61 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  29.32 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  27.64 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  32.06 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  29.66 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  28.89 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  29.5 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  29.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  29.63 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.3 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.92 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  28.32 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  26.42 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  27.88 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  25.55 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  24.59 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  26.79 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  25.49 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  25.49 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  25.49 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  25.49 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  25.25 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  25.38 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  30.38 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  25.49 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  24.81 
 
 		 137 aa  43.5  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  26.09 
 
 		 158 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  24.62 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  32.73 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>