82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4053 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 		 184 aa  387  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.2 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.2 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.06 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.06 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.18 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  36 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.57 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  39.44 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  33.67 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  34.69 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  30.39 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  28.72 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  31.61 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  31.61 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  30.68 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  28.72 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  29.23 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  27.84 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  33.94 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.16 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.59 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.15 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.95 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.56 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228157  hitchhiker  0.0000391115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.81 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2110  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.85 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3442  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.77 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.81 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5868  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.84 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.767299  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.66 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1026  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.33 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.392091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.66 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.44 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.5 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.6 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  25.54 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.17 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.654694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.44 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.15 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297316  normal  0.572597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.72 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.72 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.17 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  29.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4624  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.17 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.38 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.13 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.67 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.33 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1193  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  26.36 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.120048 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.83 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2161  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  23.84 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.780711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0724  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.91 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.97 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05820  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.300525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.16 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0745  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.57 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.45 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.38 
 
 		 211 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.97 
 
 		 217 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.14 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.45 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24050  pyridoxamine-phosphate oxidase  27.36 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.88 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.17 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>