More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4004 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  44.29 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  43.33 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  41.23 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  40.57 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  34.74 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  33.65 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  36.36 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  36.41 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  37.13 
 
 		 196 aa  122  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  36.06 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  33.95 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  33.8 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  39.44 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  41.15 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  35.21 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  38.05 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  35.92 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  35.75 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  35.44 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  35.12 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  33.66 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  35.24 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  32.56 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  33.85 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  34.78 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  33.17 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  32.95 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  37.84 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  33.71 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  35.81 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  32.04 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  31.55 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  35.78 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.01 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.31 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  33.03 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  31.73 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  32.39 
 
 		 269 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  32.11 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  32.98 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  33.18 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  31.43 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  32.57 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  31.37 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.05 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  39.74 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.94 
 
 		 365 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  31.46 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  38.33 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  31.28 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  30.88 
 
 		 371 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  29.72 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  28.86 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  28.86 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.54 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  27.36 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  31.4 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  29.25 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.37 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  25.78 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  26.47 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  31.28 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  29.81 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  28.43 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  32.67 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  25.49 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  28.9 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  29.77 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  28.97 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  27.6 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  27.62 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  35.57 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  27.22 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  27.14 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  27.14 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  36 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  31.58 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  29.81 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  27.18 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  29.58 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  26.83 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  30.92 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  27.36 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  35.2 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  26.54 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.77 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  27.42 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  26.98 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  29.9 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.13 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  24.88 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>