More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4001 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  38.99 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  37.65 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  41.45 
 
 		 153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.97 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  36.48 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.84 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.5 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.93 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.13 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  35.57 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  34.84 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 219 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  33.99 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.91 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32.91 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  32.05 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  32 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 451 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  33.64 
 
 		 451 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 455 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 455 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 309 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 419 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  27.88 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  25.47 
 
 		 439 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.77 
 
 		 264 aa  67.8  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 378 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  25.15 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 435 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  25.73 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  27.54 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 356 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 378 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  26.95 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  29.29 
 
 		 410 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.51 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.51 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  26.22 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.51 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.51 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>