122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3925 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  100 
 
 
477 aa  986    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  62.06 
 
 
283 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  52.36 
 
 
309 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  52.33 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  45.42 
 
 
305 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  43.8 
 
 
294 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  44.36 
 
 
339 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  40 
 
 
285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0778  hypothetical protein  48.62 
 
 
180 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  33.08 
 
 
335 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  34.78 
 
 
312 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  32.7 
 
 
324 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0384  hypothetical protein  36.36 
 
 
220 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.726485  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  34.82 
 
 
298 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  32.58 
 
 
287 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3501  hypothetical protein  37.04 
 
 
222 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.371327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  32.58 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  31.7 
 
 
291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  30.22 
 
 
272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  30.58 
 
 
272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  30.22 
 
 
275 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  30.22 
 
 
275 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  31.05 
 
 
275 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  29.86 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  29.86 
 
 
275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  29.86 
 
 
275 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  29.86 
 
 
275 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2405  putative esterase  29.64 
 
 
273 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000464858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  29.5 
 
 
272 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  29.25 
 
 
310 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  30 
 
 
309 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  36.13 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  32.31 
 
 
288 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  27.42 
 
 
304 aa  94.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  32.64 
 
 
288 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  27.5 
 
 
273 aa  93.2  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  35.35 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  27.87 
 
 
329 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  27.13 
 
 
273 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  25.88 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  36.93 
 
 
420 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.22 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  28.81 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  34.59 
 
 
460 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  31.58 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  34.59 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  26.67 
 
 
276 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  28.85 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  27.75 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  30.17 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  33.77 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  27.88 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  31.25 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  29.41 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  28.16 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  31.22 
 
 
330 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  33.15 
 
 
295 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  26.74 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  25.19 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  25.19 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  29.11 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  31.25 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  29.61 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  25.88 
 
 
288 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0676  putative esterase  47.95 
 
 
79 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  29.14 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  27.18 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  29.14 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  24.5 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  28.48 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  28.28 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  25.53 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  27 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2370  putative esterase  28.04 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  29.69 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  28.17 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  31.06 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  26.07 
 
 
280 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4185  hypothetical protein  27.59 
 
 
183 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  26.96 
 
 
400 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4810  putative esterase  27.43 
 
 
363 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  22.35 
 
 
262 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5552  putative esterase  22.51 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.927665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  26.52 
 
 
285 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  27.96 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  26 
 
 
342 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29340  hypothetical protein  24.08 
 
 
304 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3965  hypothetical protein  23.27 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.956387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0583  putative esterase  23.08 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07801  putative siderophore-degrading esterase (Eurofung)  40.26 
 
 
303 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1067  putative esterase  25.37 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.256453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  26.7 
 
 
307 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1038  putative esterase  25.37 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  29.35 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0297  hydrolase  24.39 
 
 
272 aa  57.4  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00178815  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6478  esterase  23.2 
 
 
293 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0975  putative esterase  28.07 
 
 
321 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  29.05 
 
 
284 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  30.11 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4575  putative esterase  23.68 
 
 
259 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.971846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>