124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3868 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  100 
 
 
250 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  48.56 
 
 
254 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  48.15 
 
 
254 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  48.15 
 
 
254 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  48.15 
 
 
254 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  47.95 
 
 
251 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  48.99 
 
 
251 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  49.38 
 
 
252 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  4.4786e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  47.86 
 
 
249 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  48.28 
 
 
247 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  48.33 
 
 
248 aa  230  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.75833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  50.21 
 
 
260 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  51.32 
 
 
245 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  47.3 
 
 
245 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  47.3 
 
 
245 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  49.57 
 
 
246 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  45.64 
 
 
245 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  47.84 
 
 
252 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  48.13 
 
 
245 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  49.38 
 
 
252 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  46.44 
 
 
245 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  46.06 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  46.06 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  46.06 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  46.06 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  46.06 
 
 
245 aa  220  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  45.23 
 
 
245 aa  219  2e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  42.91 
 
 
248 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  46.03 
 
 
245 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  46.91 
 
 
252 aa  218  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  47.72 
 
 
245 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.86023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  42.56 
 
 
244 aa  213  2e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  43.5 
 
 
251 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  45.06 
 
 
251 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  47.72 
 
 
245 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  47.72 
 
 
245 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  40.33 
 
 
245 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  43.2 
 
 
250 aa  204  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  44.08 
 
 
247 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  41.23 
 
 
241 aa  197  2e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  41.6 
 
 
238 aa  184  1e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  39.5 
 
 
248 aa  183  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  37.07 
 
 
235 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  40 
 
 
240 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.19827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  38.2 
 
 
237 aa  172  4e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  36.4 
 
 
239 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  36.51 
 
 
242 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.35059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  36.75 
 
 
243 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  36.68 
 
 
240 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  36.12 
 
 
244 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  36.86 
 
 
239 aa  152  6e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  36.32 
 
 
238 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  36.6 
 
 
238 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  30.6 
 
 
236 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  28.57 
 
 
270 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.49 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  24.4 
 
 
574 aa  73.6  3e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.4 
 
 
245 aa  72.4  6e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.08896e-05  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0277  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  23.4 
 
 
259 aa  67  2e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  25.19 
 
 
246 aa  65.1  1e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  25.12 
 
 
574 aa  64.3  2e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  23.92 
 
 
598 aa  62  8e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  21.29 
 
 
275 aa  61.6  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  26.56 
 
 
592 aa  59.3  6e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1053  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  24.51 
 
 
259 aa  58.9  7e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  25.35 
 
 
578 aa  57.4  2e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.11495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  25.47 
 
 
594 aa  57.4  2e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  25.2 
 
 
573 aa  56.6  4e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  23.85 
 
 
586 aa  55.8  6e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  25.33 
 
 
562 aa  55.1  1e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  24.64 
 
 
557 aa  54.7  1e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  26.22 
 
 
563 aa  55.1  1e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  23.47 
 
 
574 aa  55.1  1e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  22.18 
 
 
572 aa  55.1  1e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  22.54 
 
 
536 aa  52.4  7e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1660  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.84 
 
 
259 aa  52.4  7e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  7.06584e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1502  histidinol-phosphatase  23.66 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  27.49 
 
 
570 aa  50.4  3e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  25.88 
 
 
580 aa  50.4  3e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  32.99 
 
 
558 aa  48.9  8e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  29.41 
 
 
577 aa  48.9  8e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  30.3 
 
 
576 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  25.9 
 
 
578 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  20.41 
 
 
572 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
580 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  31.37 
 
 
572 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1445  PHP domain-containing protein  22.68 
 
 
259 aa  47  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0813592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  22.92 
 
 
560 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  22.17 
 
 
573 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.26901e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  24.03 
 
 
586 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  22.17 
 
 
573 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  22.17 
 
 
572 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  26.51 
 
 
560 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>