45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3838 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  54.51 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  55.31 
 
 		 291 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  52.26 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  52.78 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  52.08 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.43 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  54.01 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  53.48 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  53.12 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  51.64 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  51.95 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  54.67 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  47.04 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  37.37 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  38.59 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  35.33 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  33.66 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  35 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  30.43 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  33.89 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  30.87 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  30.87 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  34.81 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  30.85 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  31.51 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  31.54 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  29.33 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  31.72 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  31.74 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  29.11 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  29.59 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  32.54 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  30.13 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.58 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  24.05 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  20.63 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>