67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3772 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.24 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.54 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.98 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.2 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  31.6 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.08 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  28.63 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.93 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  28 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.82 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.74 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  28.69 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.13 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.22 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  26.23 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  26.69 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  23.23 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  24.82 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  22.54 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  26.84 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.98 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  25.31 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.97 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.8 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.9 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.11 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.55 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  22.88 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.54 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  26.32 
 
 		 416 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.91 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.24 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.67 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.37 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  24.4 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.4 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.08 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.4 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.03 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  20.55 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  23.81 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.66 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  21.63 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  21.79 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  21.79 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.36 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  21.43 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.47 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  22.73 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  23.12 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>