More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3750 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  796    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.84 
 
 
386 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.95 
 
 
385 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
384 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  59.33 
 
 
386 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.7 
 
 
386 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.77 
 
 
386 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.22 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
387 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.88 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.61 
 
 
385 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.32 
 
 
387 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
385 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.7 
 
 
393 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  44.56 
 
 
387 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.72 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.6 
 
 
384 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 
398 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 
399 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.36 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.36 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.97 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
400 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.35 
 
 
400 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
400 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.45 
 
 
400 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.63 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 
395 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.98 
 
 
383 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  35.49 
 
 
382 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
382 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.23 
 
 
382 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2727  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
391 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.639265 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.73 
 
 
383 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
383 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
383 aa  225  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
381 aa  225  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
383 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
393 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.38 
 
 
393 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 
872 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
368 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
383 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  33.95 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  35.16 
 
 
388 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
382 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  33.77 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
383 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
383 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
382 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
382 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
385 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  34.97 
 
 
382 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  35.23 
 
 
382 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
387 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.82 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  34.72 
 
 
382 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
383 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
383 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  34.71 
 
 
369 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.37 
 
 
382 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  35.14 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  32.73 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  34.2 
 
 
382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.12 
 
 
382 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
399 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  34.29 
 
 
382 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  36.01 
 
 
395 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>