More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3730 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.59 
 
 		 784 aa  735    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  48.58 
 
 		 808 aa  733    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.16 
 
 		 762 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  46.68 
 
 		 778 aa  665    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.87 
 
 		 792 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 805 aa  1647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  43.94 
 
 		 777 aa  639    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  46.68 
 
 		 778 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  45.48 
 
 		 772 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 		 771 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  42.87 
 
 		 790 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.05 
 
 		 782 aa  609  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.86 
 
 		 807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  41.54 
 
 		 1037 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 		 756 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.77 
 
 		 760 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.84 
 
 		 783 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  38.77 
 
 		 802 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  38.47 
 
 		 788 aa  522  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.66 
 
 		 751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  38.2 
 
 		 811 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 		 755 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.83 
 
 		 795 aa  515  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  38.08 
 
 		 743 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.12 
 
 		 757 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  39.63 
 
 		 859 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.84 
 
 		 769 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.9 
 
 		 773 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  37.03 
 
 		 765 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 		 766 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  38.39 
 
 		 753 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.47 
 
 		 785 aa  479  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 		 769 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.41 
 
 		 766 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.01 
 
 		 798 aa  475  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  37.99 
 
 		 774 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.35 
 
 		 754 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.68 
 
 		 751 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.53 
 
 		 760 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  36.01 
 
 		 763 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  37.98 
 
 		 772 aa  465  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  36.71 
 
 		 765 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  36.56 
 
 		 755 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  36.93 
 
 		 789 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  35.94 
 
 		 765 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 		 801 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  34.9 
 
 		 743 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  36.59 
 
 		 755 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.05 
 
 		 778 aa  462  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  36.06 
 
 		 765 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.22 
 
 		 799 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.13 
 
 		 791 aa  462  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  36.43 
 
 		 755 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  36.31 
 
 		 755 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  35.94 
 
 		 765 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.94 
 
 		 765 aa  459  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 765 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  35.94 
 
 		 765 aa  459  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  35.94 
 
 		 765 aa  459  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  36.39 
 
 		 772 aa  459  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  35.81 
 
 		 765 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  35.81 
 
 		 765 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.39 
 
 		 760 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.83 
 
 		 769 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.59 
 
 		 804 aa  449  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.87 
 
 		 768 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 817 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.08 
 
 		 768 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.16 
 
 		 738 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  36.84 
 
 		 768 aa  445  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.66 
 
 		 760 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.54 
 
 		 768 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  35.73 
 
 		 764 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 		 763 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.47 
 
 		 721 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.39 
 
 		 764 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  35.2 
 
 		 763 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.12 
 
 		 807 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.65 
 
 		 763 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 752 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  35.96 
 
 		 759 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.27 
 
 		 763 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  35.16 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.61 
 
 		 806 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  37.59 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.21 
 
 		 765 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  36.4 
 
 		 738 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 		 771 aa  425  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 		 764 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  36.29 
 
 		 737 aa  423  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  36.22 
 
 		 750 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  35.11 
 
 		 727 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  35.71 
 
 		 739 aa  422  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  35.11 
 
 		 727 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  35.83 
 
 		 787 aa  419  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.12 
 
 		 762 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.61 
 
 		 759 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  35.49 
 
 		 759 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>