More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3723 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  44.51 
 
 
891 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
903 aa  1850    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1234 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  39.04 
 
 
1200 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1230 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1303 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1234 aa  320  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  38.22 
 
 
1236 aa  320  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1165 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1236 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1245 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1236 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1236 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 
1188 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
1236 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1238 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1238 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
964 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
1310 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1238 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
1238 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.61 
 
 
1763 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1267 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1765 aa  300  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1118 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1202 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  33.44 
 
 
614 aa  292  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1033 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1042 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1313 aa  291  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
990 aa  290  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1582 aa  290  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  33.02 
 
 
1064 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
1009 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.68 
 
 
1030 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.82 
 
 
932 aa  288  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.39 
 
 
932 aa  287  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  33.7 
 
 
977 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
721 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.73 
 
 
2035 aa  282  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  35.66 
 
 
1021 aa  282  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.11 
 
 
1287 aa  282  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
909 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
993 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.15 
 
 
1014 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
946 aa  281  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
1560 aa  281  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  35.01 
 
 
847 aa  280  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  35.15 
 
 
891 aa  279  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1316 aa  278  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1681 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  36.24 
 
 
1686 aa  278  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  29.97 
 
 
918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  36.8 
 
 
1070 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  29.97 
 
 
918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
916 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.25 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.83 
 
 
927 aa  275  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  33.89 
 
 
1119 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  36 
 
 
1118 aa  274  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
1054 aa  274  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.28 
 
 
918 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
977 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.9 
 
 
923 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
835 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
929 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  30.38 
 
 
783 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.83 
 
 
1653 aa  271  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
991 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.88 
 
 
918 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.95 
 
 
918 aa  269  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.26 
 
 
727 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.8 
 
 
926 aa  269  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
985 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  31.6 
 
 
833 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.22 
 
 
937 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.72 
 
 
918 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.75 
 
 
918 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.57 
 
 
918 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  35.7 
 
 
931 aa  268  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.57 
 
 
918 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
782 aa  268  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.88 
 
 
929 aa  267  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1072 aa  266  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  34.94 
 
 
1417 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1643 aa  266  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1333 aa  266  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1426 aa  266  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
1314 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.81 
 
 
1177 aa  266  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  32.89 
 
 
785 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  34.21 
 
 
1297 aa  265  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.68 
 
 
1055 aa  264  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>