More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3718 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  58.77 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  57.89 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  57.46 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  57.89 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  57.46 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  57.02 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  56.33 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  56.58 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  57.89 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  57.46 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  57.89 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  55.9 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  56.14 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  55.84 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  57.45 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  55.26 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  56.09 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  61.42 
 
 		 202 aa  250  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  54.19 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  54.19 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  53.91 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  53.3 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  56.88 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  52.63 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  59.42 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  52.84 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  54.82 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  59.9 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  51.32 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  51.09 
 
 		 234 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  50.87 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  50.66 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  52.17 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  54.78 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  50.66 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50.66 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  48.7 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  53.04 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  55.41 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  50.66 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  51.1 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  51.32 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  53.51 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  52.19 
 
 		 257 aa  227  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  50.44 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  53.99 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  52.63 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  53.28 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  49.56 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  51.1 
 
 		 230 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  55.22 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  55.22 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  49.56 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  52.63 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  52.63 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  52.63 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  52.63 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  52.63 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  52.63 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  52.63 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  49.56 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  49.34 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  51.32 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  53.07 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  55.22 
 
 		 232 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  54.73 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  49.12 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  54.73 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  53.66 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  49.34 
 
 		 231 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  53.05 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  51.1 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  48.9 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  49.77 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3702  alanine racemase domain protein  53.3 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  48.73 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  50.22 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  51.1 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  47.81 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  51.53 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  49.34 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  48.9 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  48.44 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  49.15 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  48.46 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  54.73 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  49.15 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  50.22 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  48.03 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  48.72 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>