32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3704 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  44.75 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  39.46 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  37.57 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  39.89 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  38.42 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  34.24 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  34.24 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  32.07 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  34.16 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  31.07 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  33.92 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  31.21 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  32.1 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  30.67 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.67 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  29.38 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  27.12 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  24.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  23.66 
 
 		 346 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  23.02 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  22.63 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  22.63 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  24.43 
 
 		 465 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  22.63 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  22.63 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  22.63 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  24.84 
 
 		 431 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>