More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3610 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  100 
 
 		 363 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  51.85 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  45.9 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  44.54 
 
 		 378 aa  294  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  43.52 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  43.41 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  43.41 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  44.86 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  44.09 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  43.68 
 
 		 378 aa  285  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  44.86 
 
 		 362 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  43.41 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  43.19 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  44.86 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  41.99 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  42.86 
 
 		 411 aa  275  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  46.06 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  43.27 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  36.8 
 
 		 416 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  37.59 
 
 		 444 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  37.31 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  34.83 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  37.31 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  36.9 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  37.06 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  37.06 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  38.64 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  36.39 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  36.39 
 
 		 427 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  36.39 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  35.88 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  35.88 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  35.88 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  35.88 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  35.88 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  35.88 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  35.88 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  36.13 
 
 		 427 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  35.88 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  36.54 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  37.63 
 
 		 433 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  33.49 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  34.81 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  35.05 
 
 		 441 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  35.79 
 
 		 424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  34.96 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  36.52 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  36.39 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.88 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  33.65 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  36.13 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  33.88 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  33.06 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  32.84 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  35.56 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  33.24 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.22 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  30.71 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  31.61 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  36.12 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  33.55 
 
 		 405 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  32.27 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  31.96 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  32.27 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.15 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  31.15 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  32.41 
 
 		 410 aa  172  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  31.23 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  30.36 
 
 		 380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  30.36 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  28.06 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  56.76 
 
 		 117 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  27.59 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  27.59 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  28.38 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  42.34 
 
 		 477 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  29.38 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  30.63 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  38.65 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.11 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.86 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.51 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.36 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.13 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  43.28 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.44 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  28.61 
 
 		 379 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  28.25 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  23.83 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  26.2 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  36.7 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.65 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  28.73 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  26.33 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.69 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.53 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.27 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  29.73 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>