More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3583 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
397 aa  819    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  50.89 
 
 
410 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.93 
 
 
394 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
405 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  42.38 
 
 
403 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  41.84 
 
 
396 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
373 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
396 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
570 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  34.27 
 
 
414 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
415 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
375 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2174  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2158  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5747  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00131351  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  40.29 
 
 
405 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  40.29 
 
 
405 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  40.29 
 
 
405 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  41.25 
 
 
684 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  35.22 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
684 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4542  GAF domain protein  42.31 
 
 
166 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  33.6 
 
 
395 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
734 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  35.77 
 
 
471 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
442 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  41.67 
 
 
166 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
382 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  35.2 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
618 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  33.09 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
382 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  34.39 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  33.48 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  36.24 
 
 
387 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  33.8 
 
 
373 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
368 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
460 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
393 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  34.51 
 
 
306 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  35.19 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  31.47 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  29.93 
 
 
371 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  31.43 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  35.71 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  31.14 
 
 
383 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
912 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  32.7 
 
 
728 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  33.02 
 
 
728 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
376 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
760 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
730 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  31.36 
 
 
447 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  30.12 
 
 
742 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
461 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  32.98 
 
 
209 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
377 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
399 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
431 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  33.33 
 
 
643 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 
844 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
844 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  27.17 
 
 
755 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 
774 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
752 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  29.93 
 
 
678 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  30.77 
 
 
364 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
405 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
431 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
431 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  30.92 
 
 
375 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
597 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
375 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  28.35 
 
 
385 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
1084 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.9 
 
 
643 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
515 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  28.69 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
639 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
370 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
738 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.89 
 
 
501 aa  99  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
639 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  27.95 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>