90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3569 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 292 aa  607  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  32.82 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  32.43 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  32.43 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  32.32 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  32.31 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  28.87 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  31.92 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  31.92 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  31.92 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  29.9 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  31.54 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  31.97 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  29.96 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  29.52 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  24.54 
 
 		 281 aa  92.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  25.65 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  24.35 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  24.35 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  24.23 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  24.6 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  24.6 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  24.6 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  26.11 
 
 		 491 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  24.05 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  23.26 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  22.84 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  22.11 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  25.77 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  22.22 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  22.83 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  20.51 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  24.23 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  21.89 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.15 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  25.77 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  25.77 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  22.89 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  25.77 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  25.77 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  25.77 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  24.58 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  27.91 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  24.3 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.64 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.26 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.26 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.26 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.26 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.26 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  22.04 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  23.94 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  22.38 
 
 		 460 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  22.83 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  22.81 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  19.91 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  24.08 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  22.12 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  21.93 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  25.55 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  19.23 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.09 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  20.98 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  21.26 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  23.11 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  26.17 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  22.6 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  23.02 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  23.2 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  21.92 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  24.06 
 
 		 445 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>