158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3539 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  45.32 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  41.4 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  41.18 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  42.16 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  54.96 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  44.55 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  42.36 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  43.41 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  43.14 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  43.07 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  42.93 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  41.67 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  43.69 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  43.69 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  42.93 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  42.44 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  41.67 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  40.69 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  39.6 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  36.49 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  36.49 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  35.79 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  36.1 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.1 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  33.33 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  35.12 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  36.18 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  33.81 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  33.8 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  44.9 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.63 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.12 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  38.4 
 
 		 368 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  29.36 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.36 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  30.35 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  42.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  44.19 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  28.64 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  42.86 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  43.04 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  39.33 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  34.04 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  40.23 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  42.11 
 
 		 354 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.96 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.23 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.68 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  32.74 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  38.89 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  31.02 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  40.7 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  40.7 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  40.7 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  40.7 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  35.24 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  40.7 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  34.95 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  36.67 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  41.25 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  39.77 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  38.04 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  37.97 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  41.46 
 
 		 404 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  32.22 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  33.71 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  26.57 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  34.88 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  36.47 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  36.47 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  37.21 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  37.21 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  37.21 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  37.21 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  37.21 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  30.6 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  35.8 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 369 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  45.31 
 
 		 93 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  39.68 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  31.93 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  31.93 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  42.19 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.06 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  32.22 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  31.93 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  34.48 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  39.06 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  32.97 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  40.62 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  37.21 
 
 		 582 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  34.09 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  42.86 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>