261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3528 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3528  cell division protein MraZ  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00082  hypothetical protein  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4474  cell division protein MraZ  63.82 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3576  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.817951  hitchhiker  0.000645045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3396  cell division protein MraZ  63.82 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3527  cell division protein MraZ  63.82 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0087  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0074  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00081  hypothetical protein  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0089  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.818798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0083  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0086  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.471312  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0135  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0131  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0128  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0136  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0131  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.604407  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3519  MraZ protein  63.16 
 
 
152 aa  210  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2927  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  208  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3789  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  207  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0752  cell division protein MraZ  63.16 
 
 
152 aa  206  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0627  cell division protein MraZ  61.18 
 
 
152 aa  205  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3601  cell division protein MraZ  62.5 
 
 
152 aa  205  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1138  MraZ protein  63.82 
 
 
152 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0170605  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0601  cell division protein MraZ  61.84 
 
 
152 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0349  cell division protein MraZ  60.53 
 
 
152 aa  201  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0639  cell division protein MraZ  60.53 
 
 
152 aa  196  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0345  cell division protein MraZ  59.09 
 
 
152 aa  180  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.296639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0401  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3462  cell division protein MraZ  57.89 
 
 
152 aa  176  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3820  cell division protein MraZ  55.92 
 
 
152 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0393  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0478  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0377  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.785463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0418  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0392  cell division protein MraZ  57.24 
 
 
152 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3579  cell division protein MraZ  56.58 
 
 
152 aa  173  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.432184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3752  cell division protein MraZ  56.58 
 
 
152 aa  173  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4228  cell division protein MraZ  56.58 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0404  cell division protein MraZ  56.58 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03267  MraZ protein  74.07 
 
 
108 aa  170  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57460  cell division protein MraZ  52.63 
 
 
151 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13160  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
152 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0913  cell division protein MraZ  52.63 
 
 
151 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361381  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4993  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4542  cell division protein MraZ  57.89 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0110468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1328  cell division protein MraZ  51.32 
 
 
157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293135  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0346  cell division protein MraZ  53.29 
 
 
152 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2202  cell division protein MraZ  54.33 
 
 
150 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.652651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4682  cell division protein MraZ  51.97 
 
 
151 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4111  cell division protein MraZ  58.73 
 
 
151 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00625332  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4417  marZ family protein  57.94 
 
 
151 aa  157  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2100  cell division protein MraZ  49.66 
 
 
152 aa  156  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.713694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2437  cell division protein MraZ  55.73 
 
 
152 aa  155  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  53.68 
 
 
146 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3813  cell division protein MraZ  49.34 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0558  hypothetical protein  54.84 
 
 
176 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  46.71 
 
 
152 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  46.71 
 
 
152 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  48.03 
 
 
152 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2870  hypothetical protein  49.34 
 
 
149 aa  147  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  48.03 
 
 
160 aa  147  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0760  cell division protein MraZ  49.34 
 
 
150 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.776691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0110  hypothetical protein  48.03 
 
 
148 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  46.05 
 
 
147 aa  140  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2278  cell division protein MraZ  46.05 
 
 
148 aa  140  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  50.39 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  47.06 
 
 
151 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2461  cell division protein MraZ  45.99 
 
 
150 aa  130  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  47.29 
 
 
151 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  47.29 
 
 
151 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0441  MraZ protein  44.62 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3507  cell division protein MraZ  43.38 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3436  cell division protein MraZ  43.85 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2988  cell division protein MraZ  38.16 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  40.52 
 
 
143 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2560  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1109  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3137  cell division protein MraZ  36.36 
 
 
151 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52054  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0481  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1340  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3534  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3559  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3223  cell division protein MraZ  38.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0479  cell division protein MraZ  38.06 
 
 
142 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0454  cell division protein MraZ  38.06 
 
 
142 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.649318  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0521  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0068  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2845  cell division protein MraZ  38.06 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373561  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0550  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
142 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3462  MraZ protein  40.88 
 
 
150 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3636  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
142 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0158  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
143 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3679  cell division protein MraZ  35.71 
 
 
142 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.954667  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2989  cell division protein MraZ  35.71 
 
 
142 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2853  cell division protein MraZ  38.97 
 
 
142 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3098  cell division protein MraZ  37.5 
 
 
142 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>