More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3510 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  59.84 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  56.35 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  51.56 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  54.4 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  53.6 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  51.56 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  53.6 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  53.6 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  52.8 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  52.8 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  52.8 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  47.89 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  54.62 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  51.2 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  49.61 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  50 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  50 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  48.06 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  48.78 
 
 		 317 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.44 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.44 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  50.41 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  48.41 
 
 		 319 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  45.8 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  49.62 
 
 		 316 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  48.12 
 
 		 315 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.09 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.51 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  49.6 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  51.2 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  44.53 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  44.53 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  44.53 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  48.12 
 
 		 314 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.24 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  47.37 
 
 		 315 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  48.12 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  48.12 
 
 		 314 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  47.37 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42.42 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.98 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  46.62 
 
 		 313 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  47.37 
 
 		 314 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  46.62 
 
 		 314 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.97 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  46.72 
 
 		 321 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.65 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  47.37 
 
 		 313 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  47.24 
 
 		 329 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  46.56 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  43.09 
 
 		 316 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.97 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.35 
 
 		 396 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  45.6 
 
 		 306 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40.94 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  43.55 
 
 		 322 aa  96.7  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  43.51 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  35.71 
 
 		 399 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  43.51 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  42.62 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.62 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  40 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  40 
 
 		 352 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  51.09 
 
 		 316 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.5 
 
 		 400 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.18 
 
 		 302 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.48 
 
 		 384 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  39.68 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  35.43 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.7 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  35.48 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  42.86 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  42.86 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.07 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.1 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.7 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.07 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>