More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3498 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 
202 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  51.71 
 
 
207 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  59.61 
 
 
207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  51.49 
 
 
204 aa  205  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  52.68 
 
 
208 aa  204  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.29 
 
 
205 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.58 
 
 
203 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.8 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 
210 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.91 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  37.88 
 
 
206 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.88 
 
 
206 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.63 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.35 
 
 
207 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.35 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
212 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  35.2 
 
 
209 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.94 
 
 
204 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  34.69 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.01 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.68 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.35 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  34.39 
 
 
197 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  34.92 
 
 
197 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  33.17 
 
 
210 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1719  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.36 
 
 
212 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  33.82 
 
 
197 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.12 
 
 
217 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.37 
 
 
197 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.66 
 
 
204 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.67 
 
 
214 aa  102  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.82 
 
 
209 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.69 
 
 
209 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  34.78 
 
 
210 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.83 
 
 
209 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2079  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.81 
 
 
209 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00616176  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 
219 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.67 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  30.57 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.68 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 
200 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 
219 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.35 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.5 
 
 
206 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.29 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  29.23 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.16 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.05 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.21 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  29.26 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  32.52 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  31.22 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.16 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3316  multiple antibiotic resistance protein  31.43 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0229288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.37 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  31.03 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  31.37 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.73 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.66 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.69 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  29.29 
 
 
197 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  30.73 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.66 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  31.68 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.69 
 
 
197 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  30.73 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.06 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  32.52 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.29 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.29 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.59 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  32.81 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  33.66 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.29 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.08 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30.54 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  29.15 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  29.15 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  29.15 
 
 
206 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>