57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3468 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  761    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  50.42 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  30.73 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  29.49 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  31.08 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  31.64 
 
 		 369 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  29.54 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  30 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  30.29 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  31.5 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  30.28 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  28.01 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  29.28 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  27.98 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  28.25 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  28.17 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  28.31 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  30.63 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  26.59 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  31.52 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  29.08 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  27.45 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  27.55 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  29.1 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  26.61 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  28.85 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  31.35 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  29.48 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.66 
 
 		 983 aa  102  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  28.21 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  29.06 
 
 		 348 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  25.35 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  27.02 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  26.64 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  27.2 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  24.65 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  25.2 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  24.28 
 
 		 994 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  25.48 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  26.71 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  23.91 
 
 		 999 aa  73.6  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  28.52 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  24.15 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  25.69 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  27.17 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  26.25 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  22.59 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  24.41 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  26.78 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  23.62 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  25.07 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  25.66 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  25.66 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  24.05 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>