More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3459 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 582 aa  1201    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  52.11 
 
 		 571 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  46.64 
 
 		 572 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  44.68 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  44.32 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  42.06 
 
 		 586 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  42.02 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  42.46 
 
 		 625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  43.45 
 
 		 623 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  41.97 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  43.45 
 
 		 623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  43.27 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  41.89 
 
 		 588 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  43.27 
 
 		 593 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 		 581 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  41.96 
 
 		 610 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  42.81 
 
 		 628 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  40.67 
 
 		 653 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  41.5 
 
 		 596 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  42.73 
 
 		 575 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  41.16 
 
 		 580 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  39.61 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  39.86 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  40.96 
 
 		 624 aa  379  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  40.88 
 
 		 648 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  40.53 
 
 		 625 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 		 624 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  40.85 
 
 		 596 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  40.57 
 
 		 669 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  40.6 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  41.09 
 
 		 595 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  40.18 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  40.63 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  40.18 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  41.64 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  40.28 
 
 		 626 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  39.83 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  41.42 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  40.17 
 
 		 658 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  37.32 
 
 		 596 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  41.25 
 
 		 621 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  41.43 
 
 		 696 aa  357  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  39.84 
 
 		 662 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  39.38 
 
 		 648 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 		 619 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  38.34 
 
 		 634 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  38.34 
 
 		 634 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  38.34 
 
 		 634 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  38.99 
 
 		 643 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.37 
 
 		 623 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 627 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 627 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 627 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 626 aa  327  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  38.16 
 
 		 692 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 		 627 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  37.63 
 
 		 691 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  36.93 
 
 		 662 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 		 627 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  37.44 
 
 		 662 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 		 661 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 		 661 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  36.95 
 
 		 616 aa  323  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  37.39 
 
 		 629 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 		 661 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  37.44 
 
 		 660 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  38.94 
 
 		 437 aa  278  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  34.65 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.86 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 580 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.44 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  35.44 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  35.44 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.97 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 		 645 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  35.26 
 
 		 580 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  35.26 
 
 		 580 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 590 aa  270  7e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.79 
 
 		 580 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  35.26 
 
 		 581 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  35.26 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.61 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.38 
 
 		 581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  34.54 
 
 		 645 aa  267  5e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.43 
 
 		 580 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.04 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.63 
 
 		 599 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 		 599 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  31.75 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  31.61 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.99 
 
 		 589 aa  246  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  32.62 
 
 		 617 aa  243  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  32.44 
 
 		 580 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>