More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3424 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  61.57 
 
 		 674 aa  775    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 674 aa  1336    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 672 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 		 674 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 		 673 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 		 673 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 673 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 673 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 		 673 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 673 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.88 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.43 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 		 673 aa  475  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.46 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 		 675 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 		 675 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.11864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 		 675 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 675 aa  276  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.38 
 
 		 675 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 		 675 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 675 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  32.94 
 
 		 666 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 		 677 aa  259  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 		 552 aa  258  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.58 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 637 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 		 678 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 		 547 aa  248  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01085  methyl-accepting chemotaxis protein  28.55 
 
 		 672 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 		 555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 		 541 aa  245  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 638 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  31.15 
 
 		 629 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 		 650 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 		 679 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 		 640 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 		 568 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 		 640 aa  234  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 		 638 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 		 638 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 634 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  35.48 
 
 		 642 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 		 674 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.97 
 
 		 712 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 		 716 aa  230  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 653 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  39.95 
 
 		 653 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  28.43 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 		 638 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 		 663 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.97 
 
 		 712 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 		 541 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 642 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  39.54 
 
 		 543 aa  228  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 		 573 aa  228  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 		 638 aa  228  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  28.1 
 
 		 672 aa  227  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 658 aa  227  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 624 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  41.74 
 
 		 634 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 		 681 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  41.93 
 
 		 623 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 540 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  40.9 
 
 		 676 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 548 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 634 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 620 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 		 558 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  40.64 
 
 		 647 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 		 541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 		 645 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 541 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  33.39 
 
 		 638 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 		 540 aa  220  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  39.94 
 
 		 633 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  39.94 
 
 		 541 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 572 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 640 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>