243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3415 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  65.16 
 
 		 288 aa  380  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  48.59 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  46.15 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  45.8 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  45.86 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  46.13 
 
 		 262 aa  252  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  45.42 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  45.1 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  46.48 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  47.16 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  47.54 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  46.45 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  45.77 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  44.37 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  46.1 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  46.1 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  46.1 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  46.74 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  42.56 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  42.56 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  42.56 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  44.01 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  42.61 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  45.3 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  40.14 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  40.14 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  40.14 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  40.14 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  40.56 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  40.14 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  40.64 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.05 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  40.14 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  40.14 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  39.79 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  41.44 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  44.02 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  44.15 
 
 		 284 aa  198  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  38.41 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  39.08 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  39.37 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  38.57 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  37.07 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  34.15 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  34.12 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  35.14 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  40 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.3 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  38.33 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.23 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  36.13 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  34.52 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  32.5 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.82 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  24.74 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  24.56 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  24.91 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  32.29 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  31.97 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.57 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.22 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  26.22 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.17 
 
 		 254 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.68 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  28.05 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.79 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.28 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  24.73 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  28.51 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  27.12 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.38 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  24.38 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.19 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.41 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  23.68 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  26.58 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.93 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  25.79 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  23.97 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.02 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.62 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  25.97 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  25.97 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  26.38 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.88 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  23.56 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  25.97 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  26.78 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1897  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.67 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.394264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  25.74 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.9 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0557  DnaJ domain-containing protein  25 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>