14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3389 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01169  hypothetical protein  33.71 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0352  hypothetical protein  29.58 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3413  hypothetical protein  27.64 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0546  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0432  hypothetical protein  23.61 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4224  hypothetical protein  23.15 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551362  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0714  hypothetical protein  22.98 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0786  hypothetical protein  23.3 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3927  hypothetical protein  24.07 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0085  hypothetical protein  24.62 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0689  hypothetical protein  22.07 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3218  hypothetical protein  22.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.279999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0601  hypothetical protein  26.19 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.089227  normal  0.335126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>