More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3338 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  70.73 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  70.54 
 
 		 242 aa  371  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  70.54 
 
 		 251 aa  367  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  71.01 
 
 		 243 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  71.01 
 
 		 243 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  69.58 
 
 		 242 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  67.21 
 
 		 247 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  69.29 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  67.09 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  67.08 
 
 		 242 aa  347  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  66.67 
 
 		 242 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  64.58 
 
 		 243 aa  344  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  64.58 
 
 		 243 aa  344  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  64.58 
 
 		 243 aa  344  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  65.42 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  63.49 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  66.53 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  65.96 
 
 		 238 aa  340  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  65.55 
 
 		 245 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  64.02 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  62.66 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  62.61 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  63.07 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  61.76 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  61.76 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  61.67 
 
 		 248 aa  322  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  61.25 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  58.33 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  56.72 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  62.87 
 
 		 176 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  62.13 
 
 		 190 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  59.64 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  61.31 
 
 		 175 aa  205  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  58.82 
 
 		 174 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  54.7 
 
 		 189 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.14 
 
 		 175 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  57.99 
 
 		 190 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  54.12 
 
 		 189 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  48 
 
 		 179 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  50.3 
 
 		 179 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  49.17 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  48.24 
 
 		 182 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  48.24 
 
 		 182 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  46.75 
 
 		 175 aa  164  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  45.25 
 
 		 181 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  45.56 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  52.23 
 
 		 159 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  45.14 
 
 		 179 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  43.96 
 
 		 184 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  48.75 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.94 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  48.43 
 
 		 157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  47.44 
 
 		 160 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  48.41 
 
 		 163 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.94 
 
 		 167 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  48.41 
 
 		 161 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  47.17 
 
 		 162 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  49.28 
 
 		 162 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  45.78 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  46.5 
 
 		 157 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  46.5 
 
 		 157 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  46.5 
 
 		 157 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  47.77 
 
 		 161 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  45.57 
 
 		 157 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  47.2 
 
 		 158 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.3 
 
 		 157 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.57 
 
 		 158 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  45.78 
 
 		 166 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  45.86 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  45 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  56.59 
 
 		 168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  45.86 
 
 		 157 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  54.89 
 
 		 168 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  45.22 
 
 		 157 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  45.22 
 
 		 157 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  45.22 
 
 		 157 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  45.28 
 
 		 157 aa  138  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  44.23 
 
 		 157 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  46.88 
 
 		 161 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.3 
 
 		 168 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.22 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  45.51 
 
 		 157 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 		 169 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  55.3 
 
 		 168 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  45.22 
 
 		 159 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.81 
 
 		 158 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  45.22 
 
 		 178 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  44.05 
 
 		 167 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  54.14 
 
 		 168 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  49.29 
 
 		 161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  49.29 
 
 		 161 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  54.55 
 
 		 192 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  44.03 
 
 		 157 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.86 
 
 		 161 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  42.77 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  43.45 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  44.03 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>