117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3307 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  100 
 
 		 449 aa  929    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  59.9 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  44.78 
 
 		 464 aa  342  7e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  41.81 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  37.12 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  35.41 
 
 		 382 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  24.56 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  30.26 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  30.26 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.57 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  31.12 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.59 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  27.47 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.15 
 
 		 545 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.23 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  29.44 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  29.23 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  27.92 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.35 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  28.77 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  35.48 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  26.94 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.05 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.63 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.63 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  25.73 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.46 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.48 
 
 		 607 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  26.46 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  25.98 
 
 		 348 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  25.98 
 
 		 348 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.02 
 
 		 318 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  26.4 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  25.23 
 
 		 570 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  29.06 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.42 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  26.38 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0602113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.52 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  26.62 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  27.6 
 
 		 572 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  27.23 
 
 		 572 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.23 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  26.5 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  35.04 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.53 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.48 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  22.91 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  28.68 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  25.46 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.25 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  25.48 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  25.48 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  23.13 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  37.14 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  27.4 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.74 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  25.48 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1122  hypothetical protein  25.48 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1035  hypothetical protein  25.7 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2349399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.89 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.57 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  24.6 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25.19 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1945  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.76 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  26.07 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  22.96 
 
 		 343 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.14 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.23 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.29 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  25.4 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7209  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  22.78 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.1 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.04 
 
 		 601 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1038  hypothetical protein  24.91 
 
 		 468 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.059236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  23.58 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  27.64 
 
 		 330 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.9 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  29.2 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.02 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  26.52 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.26 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.5 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  25.89 
 
 		 337 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  28.1 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6054  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.04 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  26.62 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  32.58 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28.47 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  24.68 
 
 		 713 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  26.37 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>