88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3274 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  54.69 
 
 		 822 aa  942    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  56.92 
 
 		 831 aa  999    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  58 
 
 		 813 aa  1020    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  49.25 
 
 		 815 aa  841    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  58 
 
 		 813 aa  1020    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  57.05 
 
 		 811 aa  999    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  59.61 
 
 		 811 aa  1051    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  57.76 
 
 		 811 aa  1004    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  100 
 
 		 822 aa  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  55.24 
 
 		 819 aa  974    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  61.96 
 
 		 811 aa  1071    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  51.78 
 
 		 815 aa  853    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  41.73 
 
 		 790 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  51.97 
 
 		 827 aa  872    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  60.42 
 
 		 811 aa  1052    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  38.73 
 
 		 784 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  38.4 
 
 		 785 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  39.31 
 
 		 784 aa  571  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  34.48 
 
 		 802 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  34.24 
 
 		 802 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  34.56 
 
 		 797 aa  492  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  34.59 
 
 		 801 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  33.66 
 
 		 794 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  34.44 
 
 		 823 aa  483  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  33.98 
 
 		 797 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  33.45 
 
 		 829 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  34.34 
 
 		 762 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  32.74 
 
 		 809 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  32.84 
 
 		 796 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  32.06 
 
 		 786 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  31.07 
 
 		 824 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  32.16 
 
 		 849 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  31.37 
 
 		 797 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  30.33 
 
 		 2845 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  30.67 
 
 		 2922 aa  353  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  29.03 
 
 		 1303 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  29.27 
 
 		 3021 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.7 
 
 		 2901 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  29.37 
 
 		 2887 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  29.8 
 
 		 2880 aa  340  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  30.11 
 
 		 2881 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  28.88 
 
 		 2786 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  30.32 
 
 		 2916 aa  321  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  30.16 
 
 		 2842 aa  320  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  30.72 
 
 		 2905 aa  319  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  29.07 
 
 		 2859 aa  319  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  29.48 
 
 		 2864 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  28.47 
 
 		 2748 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  28.55 
 
 		 2831 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  29.1 
 
 		 2929 aa  312  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  28.55 
 
 		 2868 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  28.76 
 
 		 2932 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  29.13 
 
 		 2864 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.83 
 
 		 2868 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  29.98 
 
 		 2716 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  27.8 
 
 		 2860 aa  302  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.4 
 
 		 2732 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  29.02 
 
 		 2874 aa  301  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  27.5 
 
 		 2823 aa  300  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.27 
 
 		 2864 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  28.32 
 
 		 2748 aa  297  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  27.76 
 
 		 2747 aa  297  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  28.66 
 
 		 2769 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 		 2875 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  28.88 
 
 		 2761 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  27.02 
 
 		 2888 aa  296  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  28.33 
 
 		 2758 aa  293  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  30.78 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  28.25 
 
 		 2839 aa  287  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  27.45 
 
 		 2884 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  28.54 
 
 		 2839 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  28.02 
 
 		 2870 aa  282  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  27.86 
 
 		 2833 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.19 
 
 		 2793 aa  263  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  27.48 
 
 		 2730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  26.8 
 
 		 2731 aa  251  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  26.3 
 
 		 2779 aa  236  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  23.44 
 
 		 788 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  23.79 
 
 		 801 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  21.85 
 
 		 802 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  24.3 
 
 		 984 aa  122  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  33.54 
 
 		 2453 aa  89.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  21.33 
 
 		 904 aa  75.1  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  21.78 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1113 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1100 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1094 aa  52.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>