81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3220 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 673 aa  1402    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 1476 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  32.91 
 
 		 399 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  31.7 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  32.28 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  33 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  29.41 
 
 		 423 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  36.2 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 1292 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  33.18 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  35.65 
 
 		 452 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  26.72 
 
 		 339 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 1271 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 1265 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 1303 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 1301 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.86 
 
 		 418 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 828 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 953 aa  96.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 1239 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  27.2 
 
 		 591 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 1220 aa  88.6  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 384 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  26.89 
 
 		 1147 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 746 aa  86.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  29.89 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 924 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 740 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.93 
 
 		 1182 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 1239 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  28.96 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 1192 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 1185 aa  70.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 1198 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.1 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.8 
 
 		 1191 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  28.18 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 1193 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 1190 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  31.19 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  31.54 
 
 		 268 aa  62  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  26.79 
 
 		 1608 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.03 
 
 		 2401 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  27.27 
 
 		 1165 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  27.27 
 
 		 1165 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  26.73 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  24.35 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  27 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  30.61 
 
 		 276 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1400  hypothetical protein  26.92 
 
 		 351 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 1187 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  22.14 
 
 		 372 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  23.79 
 
 		 471 aa  54.3  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  29.82 
 
 		 360 aa  53.9  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  30.25 
 
 		 362 aa  54.3  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 1213 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  28.78 
 
 		 769 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 1177 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1171 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 1359 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 1317 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 1759 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  23.4 
 
 		 269 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  26.59 
 
 		 478 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  33.67 
 
 		 1121 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  25.91 
 
 		 398 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 360 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 1301 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 		 412 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 382 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.47 
 
 		 361 aa  44.3  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0986  hypothetical protein  29.91 
 
 		 359 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  19.83 
 
 		 380 aa  43.9  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  21.79 
 
 		 361 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>