More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3207 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 576 aa  1197    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  43.76 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  45.09 
 
 		 958 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 		 733 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 		 1509 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  43.34 
 
 		 632 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  42.43 
 
 		 1275 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  42.8 
 
 		 709 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  42.8 
 
 		 709 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 625 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 		 625 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  41.16 
 
 		 602 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.79 
 
 		 1561 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.39 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 		 625 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 1486 aa  286  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  45.73 
 
 		 1359 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 		 746 aa  275  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 		 723 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 765 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 1759 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 658 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 684 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 		 652 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 670 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 		 1334 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 808 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.35 
 
 		 809 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 1152 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 1152 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 988 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 635 aa  243  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 		 832 aa  240  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 1991 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 775 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 		 717 aa  234  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 617 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 		 710 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  41.79 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  33.41 
 
 		 531 aa  230  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 721 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 684 aa  227  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 662 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  41.16 
 
 		 555 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 728 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  34.4 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  34.14 
 
 		 1067 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  41.2 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 996 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 		 783 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.56 
 
 		 1182 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  31.59 
 
 		 810 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.44 
 
 		 1644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.44 
 
 		 1644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 		 958 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 857 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 1198 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 880 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 729 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 734 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 784 aa  200  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 1193 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 790 aa  197  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 983 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 742 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 1188 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.76 
 
 		 1191 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  41.64 
 
 		 1084 aa  180  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 1190 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  39.19 
 
 		 748 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 742 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 725 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 742 aa  170  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 725 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  30.37 
 
 		 1165 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  30.37 
 
 		 1165 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 968 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 1162 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.77 
 
 		 968 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.54 
 
 		 732 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 974 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  33.77 
 
 		 972 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 1297 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.96 
 
 		 1173 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 1177 aa  153  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1171 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1694 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 1187 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  35.94 
 
 		 1003 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 1213 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  27.27 
 
 		 783 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 2046 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>